É muito fácil chegar à Cidade do João José.
A A1 (auto-estrada este-oeste) faz o caminho entre a Cidadela de Stº António e a Cidade do João José. A A4 (auto-estrada centro-sul) faz o caminho entre São José e Cidade do João José. A A6 (auto-estrada do oeste) faz ligação entre o norte e o oeste. A A10 passa pela Cidade do João José, ligando a A1, A4, A6, A14, A17 e localidades do concelho de Cadivelos. A A14 liga a Cigala e a Cidade do João José. A A17 (auto-estrada norte-sul) faz o percuso a partir da Travessa de S. Pedro, acabando na Cidade do João José. A19 atravessa a Ponte Verde, ligando a Cidade do João José à Margem Este do Filar. A A21 atravessa a Ponte D. Mauro Henrique, que funciona como alternativa da Ponte Verde. A A23 atravessa a Ponte de Stª Mariana, e funciona como alternativa da Ponte D. Mauro Henrique. A A24 atravessa a Ponte Vasco Ferreira Leite Llano Iglésias, e funciona como alternativa das Pontes D. Mauro Henrique e Sta. Mariana. A A25 atravessa a Ponte D. João José, que funciona como alternativa de congestionamento de todas as pontes. A A29 liga a Cidade do João José e Cadivelos.
Os aviões também chegam a esta cidade diariamente, durante 24 horas por dia. Os vaivéns espaciais fazem o mesmo dos aviões, mas atravessando por quase todo o espaço. Os comboios de todos os tipos chegavam antigamente na zona de S. Salvador, até 1997, e mais recentemente chegam na Praia de Coral, estação de comboios situada na Freguesia de Júpiter, a partir de 1998. Os autocarros também chegam diariamente, inclusivé durante os fins-de-semana, e chegavam antigamente na zona de Stª Mariana, e mais recentemente chegam à Praia de Coral.
